High Sensitivity Detection and Quantitation of DNA Copy Number and Single Nucleotide Variants with Single Color Droplet Digital PCR

中国福彩网山西站 www.dfpifn.com.cn 入選理由:首次在ddPCR上采用EvaGreen染料法實現了單孔、單通道情況下CNV和SNP的同時分析。

表期刊:Anal. Chem. 2014, 86, 2618?2624

作者:Laura Miotke, Billy T. Lau, Rowza T. Rumma, and Hanlee P. Ji;

文章摘要:
文獻是第一篇在伯樂公司升級后的QX200上采用EvaGreen方法由斯坦福大學的科學家完成的文獻。文章采用EvaGreen的方法僅利用單孔、單熒光信號通道就實現了對腫瘤細胞系和腸癌病人的臨床樣品進行了CNV和SNP的檢測,前者以FLT3基因為靶點,后者以BRAF V600E的靶點。

在實驗設計時,對不同擴增產物的長度進行控制,就能利用PCR反應結束后終點熒光信號強度的不同在一個反應孔內區分2種不同的產物。在FLT3 CNV的檢測中,可以區分FLT3目標基因與UC1內參基因;在BRAF V600E的突變檢測中,可以有效區分野生型與突變型對應的擴增產物。其檢測結果與采用TaqMan探針法的結果完全一致。與傳統的TaqMan探針相比,EvaGreen染料法在實驗的設計、優化以及成本的控制方面更具有推廣性。

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